动物实验设计助理EDA


周不润, NeuroTimes   |   March 1, 2016


Credits: eda.nc3rs.org.uk


过去的几年里,生物领域发表的文章被挑出大量的错误。尤其在动物实验中,不当的实验设计、错误的统计,都会带来最终结果的缺陷。很多杂志在投稿时已经要求投稿人完成一份内容审核的清单,但在投稿时关心这些显然已经太迟了。

Nature在本周的Toolbox栏目里,推荐了一个可视化动物实验设计的网络服务。这个网络服务名为Experimental Design Assistant (EDA),是由伦敦NC3Rs动物实验中心于2015年10月份开始设计的。EDA设计的初衷是希望这个网站提高动物实验的质量,甚至成为动物实验设计中一个必不可少的组成部分。

EDA的让研究者们可以直接画出实验假说、实验方法和预期结果,并用不同的线和方框连接起来,然后EDA来协助发现潜在的问题,并协助改进。简单一点的例如研究者没有设随机对照组,复杂一点的例如研究者没有控制好变量,EDA都能帮助发现并解决问题。此外,EDA还可以帮助研究者确定样本大小,以保证得到统计学上有意义的结果。

听起来并没有比我们平时的设计高级,但对于一些刚踏入科研领域的研究生,或者对实验设计没有什么把握的研究者来说,EDA是一个略智能的实验设计助理。目前,已经有400多个用户开始使用EDA进行实验设计,剑桥基因组研究中心等机构也进行了EDA的内部教学培训。

EDA主要辅助动物实验的设计。在实验设计方面,还有其他不少软件可以进行辅助,像检查格式错误或者P值有没有遗漏之类的功能。Nature举了几个例子,如需要付费的Penelope,用于提高临床试验质量的WebCONSORT,同样辅助实验室实验的免费服务Protocol Navigator等。




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