NWB推出神经生理学通用数据格式


NeuroTimes | Nov. 20, 2015


Credits: neuron


去年建立的Neurodata Without Borders计划,为了使神经科学数据标准化,以加强可重复性,和扩大研究领域。今年推出了第一个神经生理学通用数据格式,就以这个计划的名字命名,NWB(Neurodata Without Borders )。NWB是为神经科学实验最常用的细胞电生理和光学成像而设置的。

神经科学的数据随着各种技术的进步在变得越来越大,过去仅仅细胞电生理的格式就多种多样,分享、搜索、分析和整合数据都很麻烦。NWB得到推广的话,会使得不同仪器和设备得到的结果可以相互比较,更容易理解。

看得出来NWB借鉴了大量的HDF5格式,而且可与HDFView兼容。

NWB的主要特点在于:
1. 一个时间序列类,不同数据类型子类;
2. 同时编码原始数据和相关metadata,记录实验条件例如动物的性别,记录的左脑还是右脑;
3. 可扩展。

开发团队正在继续完善数据格式,开发新的分析工具。想要造轮子的可以开始动手了。

示例datasets地址http://www.nwb.org/allen-cell-types-database/
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